袋式除塵器的運轉可分為試運轉與日常運轉：
首先，進行試運轉時，必須對系統的單一部件進行檢查，然后作適應性運轉，并要作部分性能試驗。在日常運轉中，仍應進行必要的檢查，特別是對袋式除塵器的性能的檢查。要注意主機設備負荷的變化會對除塵器性能產生的影響。在機器開動之后，應密切注意袋式除塵器的工作狀況，做好有關記錄。
兩次清灰時間間隔稱清灰周期，一般希望清灰周期盡可能的長一些，使除塵器能在經濟的阻力條件下運轉。因此，必須對粉塵性質、含塵濃度等進行慎重地研究，并根據不同的清灰方法來決定清灰周期和時間，并在試運轉中進行調整達到較佳的清灰參數。
在開始運轉的時間，常常會出現一些事先預料不到情況，例如，出現異常的溫度、壓力、水分等將給新裝置造成損害。氣體溫度的急劇變化，會引起風機軸的變形，造成不平衡狀態，運轉就會發生振動。一旦停止運轉，溫度急劇下降，再重新起動時就又會產生振動。應根據氣體溫度來選用不同類型的風機。
設備試運轉的好壞，直接影響其是否能投入正常運行，如處理不當，袋式除塵器很可能會很快失去效用，因此，做好設備的試運轉必須細心和慎重。
二、日常運行
在袋式除塵器的日常運行中，由于運行條件會發生某些改變，或者出現某些故障，都將影響設備的正常運轉狀況和工作性能，要定期地進行檢查和適當的調節，目的是延長濾袋的壽命，降低動力消耗及回收有用的物料。應注意的問題有：
1、運行記錄
每個通風除塵系統都要安裝和備有必要的測試儀表，在日常運行中必須定期進行測定，并準確地記錄下來，這就可以根據系統的壓差，進、出口氣體溫度，主電機的電壓、電流等的數值及變化來進行判斷，并及時地排出故障，保證其正常運行。
通過記錄發現的問題有：清灰機構的工作情況，濾袋的工況（破損、糊袋、堵塞等問題），以及系統風量的變化等。
2、流體阻力
U型壓差計可用來判斷運行情況：如壓差增高，意味著濾袋出現堵塞、濾袋上有水汽冷凝、清灰機構失效、灰斗積灰過多以致堵塞濾袋、氣體流量增多等情況。而壓差降低則意味著出現了濾袋破損或松脫、進風側管道堵塞或閥門關閉。箱體或各分室之間有泄漏現象、風機轉速減慢等情況。
3、安全
袋式除塵器要特別注意采取防止燃燒、爆炸和火災事故的措施。在處理燃燒氣體或高溫氣體時，常常有未*燃燒的粉塵、火星、有燃燒和爆炸性氣體等進入系統之中，有些粉塵具有自燃著火的性質或帶電性，同時，大多數濾料的材質又都是易燃燒、磨擦易產生積聚靜電的，在這樣的運轉條件下，存在著發生燃燒、爆炸事故的危害，這類事故的后果往往是很嚴重的。應很好地考慮采取防火、防爆措施，如：
⑴ 在除塵器的前面設燃燒室或火星捕集器，以便使未*燃燒的粉塵與氣體*燃燒或把火星捕集下來。
⑵ 采取防止靜電積聚的措施，各部分用導電材料接地，或在濾料制造時加入導電纖維。
⑶ 防止粉塵的堆積或積聚，以免粉塵的自燃和爆炸。
⑷人進入袋室或管道檢查或檢修前，務必通風換氣，嚴防CO中毒。
