在線色譜儀 打開計算機和工作站(脂肪酸分析通道1，分析通道2)，打開方法文件：脂肪酸分析方法或分析方法。顯示屏幕的左下角應以藍色顯示電流、電壓和時間。然后，可以轉動色譜儀放大器面板上點火按鈕上的“粗調諧”旋鈕，以檢查信號是否為路徑(基線應隨著“粗調諧”旋鈕的轉動而改變)。在基線穩定進樣后，同時單擊“開始”按鈕或色譜旁邊的快捷按鈕來分析色譜數據。在分析結束時，單擊“停止”按鈕，數據將自動保存。
在線色譜儀
色譜儀使用氣源的純度要求必須在99.99％以上，但是許多操作者對于不同氣相色譜儀檢測器要求不同氣源純度的情況沒有足夠的重視。在使用中，有可能因氣源純度不夠而導致氣相色譜儀檢測器檢測基線和限高不穩定。例如使用純度為98％的氫氣作為氣相色譜儀檢測器的燃氣氣源，在檢測器的104MΩ靈敏度擋位上使用時，可能由于氫氣純度不夠而導致測器檢基線嚴重不穩，就好像有永遠顯示不完的波峰。載氣純度不高含有微量氧時就會影響到毛細管柱的使用壽命。
在使用氣相色譜儀FID氫火焰離子檢測器對樣品進行分析時，需要N2-H2-Air火焰被點燃后轉化為富氧焰，即空氣應該過量以確保氫氣*燃燒，三種氣體比例為Air：H2=(6～8)：1，N2：H2=1：(0.85～1)或空氣量應該更大。在此條件下的檢測器穩定性和靈敏度高，能夠保證作出的定量校正因子可靠。
對溫度環境的要求并不特殊，一般在5～35℃的室溫條件下即可滿足操作要求，對于濕度環境一般要求在20%～85％為宜。在高濕度的地區，使用某些型號的氣相色譜儀價格時，會因為環境濕度大而導致儀器的絕緣性能下降，若在高靈敏度擋位操作響應值則會下降。工作人員在使用儀器時遇到上述現象應該采取必要的措施。
