GeneChip™ 恒河猴基因 1.0 ST 陣列

GeneChip™ O恒河猴基因 1.0 ST 陣列使您能夠：
? 檢測該片段在整個基因中的表達情況，且分辨率和準確度均高于經典 3'-端偏倚微陣列方案
? 通過對每個轉錄本進行多次獨立測量，獲取精確且可重現的數據

背景
對比較基因組學研究、進化生物學而言，模型及應用研究生物擁有巨大價值，并且在破譯人類疾病的分子機制及農作物改良方面將持續發揮關鍵作用。GeneChip Gene 1.0 ST Array 已被開發用于分析各種模型和應用研究微生物。這些生物體是不斷壯大的基因表達微陣列家族的成員，可提供全轉錄本覆蓋。GeneChip 基因 1.0 ST 陣列由我們與研究人員合作設計，如 Roslin 研究所遺傳學和基因組學部主任 Alan Archibald（豬陣列設計）、干細胞研究計劃主管 Leonard Zon 和波士頓哈佛醫學院兒童醫院干細胞研究項目的基因組核心主任 Yi Zhou（斑馬魚陣列設計）。

關鍵優勢
? 較高的轉錄本覆蓋度 – 對良好注釋內容進行可靠的表達測定，每個轉錄本含高達26個探針
? 全轉錄組分析 – 可捕獲 3’ 端偏倚表達設計可能遺漏的轉錄本亞型
? 高數據相關性 – 可實現較高的陣列條帶間和陣列條帶內信號相關性 (R >0.99)

符合行業標準的成熟性能
GeneChip 基因 1.0 ST 陣列實現所選模型和應用研究微生物的全轉錄組覆蓋。所有設計均基于較新的基因組內容，并且提供較高的探針覆蓋范圍（完整長度基因中可多達 26 個探針）。這使得它可以精確進行全轉錄組微陣列分析檢測，并可提供比市場上其他經典 3'-端偏倚微陣列方案更高的分辨率和準確性。全轉錄組分析方法使研究人員能夠檢測多個轉錄本亞型，包括使用 3’-端偏倚表達設計時可能遺漏的亞型，如剪接變異、非多聚腺苷酸轉錄本、帶有選擇性多聚腺苷酸化位點的轉錄本以及截短轉錄本。

完整的試劑、軟件和儀器解決方案，實現更好的陣列性能
為提供方便及完整支持、將 Gene 1.0 ST Array 作為全面解決方案（包括 GeneChip 試劑和儀器）的一部分：
?GeneChip WT Sense 目標標記和對照試劑。有關檢測程序和性能的詳細信息，請參閱 WT Sense 目標標記分析手冊
? GeneChip 射流工作站 450 可進行完整的自動陣列處理，以獲得較高水平的重現性
? GeneChip 掃描儀 3000 7G，帶可選的自動加載器，可用于陣列圖像采集

我們提供多種工具來幫助您進行數據分析，包括 GeneChip Expression Console；軟件、NetAffx 分析中心和集成基因組瀏覽器 (IGB)。

Expression Console 軟件是易用型應用程序，可實現探針集匯總和初步數據質量評估。簡單的工作流程使得用戶能夠快速分析數據（見圖）。使用 GeneChip 兼容™ 軟件供應商提供的軟件應用可以進一步分析所得數據。

NetAffx 分析中心（對探針組生物學和功能注釋進行定期更新）是特別全面的陣列注釋和探針序列信息資源庫。靈活的查詢工具和外部鏈接使研究人員能夠深入研究感興趣的基因和注釋。該資源便于輕松解讀微陣列結果和快速設計下游研究。工作流程
研究人員還可以使用 IGB 來獲得基因組的可視化結果?；蚪M注釋（包括不同來源的 RefSeq 序列、SNP 和基因組位點）可以與微陣列基因表達信號數據一起查看。

基因 1.0 ST 陣列數據分析工作流程類似于 3' 基因表達分析的工作流程，利用 NetAffx 分析中心中的 Expression Console 1.1、兼容 GeneChip 的第三方軟件和注釋工具以及 IGB。

內容概況
GeneChip 基因 1.0 ST 陣列具有較新的轉錄基因組覆蓋范圍。我們使用全面的信息源來設計用于檢測每個轉錄本多達 26 個序列的探針。全部這些 26 種的 25-mer 探針可檢測每個轉錄本至多 650 個堿基。整個轉錄本的高探針覆蓋度帶來了出色的性能和數據可信度，同時也能夠隨著您對每個基因組和轉錄組的理解加深時更新您的實驗數據。