通過檢測血液中的游離DNA（cfDNA），究竟能否提供癌癥的線索，這個問題困擾了人們很久。近日，Broad研究所的研究人員在《Nature Communications》上發表文章稱，90%的腫瘤遺傳特征可通過血液樣本的全外顯子組測序檢測到，這種方法可應用在近半的晚期癌癥患者身上。  通訊作者之一、Broad研究所的Viktor Adalsteinsson博士表示：“我們的zui終目標是利用血液活檢來全面搜索和鑒定哪怕是zui小的腫瘤殘留。隨著腫瘤進展到晚期，形成耐藥性或成為轉移瘤，我們希望在關鍵的時間點介入，決定哪種療法患者。”  

對癌癥患者而言，侵入性的手術活檢是痛苦且困難的，而且有些腫瘤的位置很難觸及。如今，液體活檢正成為一種新興的替代方法。通過檢測和分析患者血液樣本中的癌癥DNA，它有望克服傳統活檢的問題，讓醫生可實時追蹤疾病進展和治療情況，并幫助研究人員了解腫瘤的耐藥性如何形成。

收集DNA片段的全外顯子組，需要血液樣本中至少有10%的腫瘤DNA，但這個比例因患者而異?；诖?，研究人員首先需要一種無偏倚的方法來測定癌癥DNA的水平，然后再開展測序。目前的許多血液活檢方法是篩查已知的癌癥相關基因，但這種靶向重測序方法可能會漏掉一些癌癥。  

在這項研究中，研究人員開發出一種稱為ichorCNA的工具，它能夠分析癌癥基因組中普遍存在的各種突變模式，捕獲帶有已知和未知突變的癌癥。此外，他們重點檢測了癌細胞中拷貝數過高或過低的DNA片段。總共有1439個血液樣本被檢測，它們來自520名轉移性乳腺癌或前列腺癌患者。  利用這種方法，研究人員發現在33%到49%的轉移性癌癥患者中，腫瘤DNA的含量超過了游離DNA的10%。這意味著游離DNA的全外顯子組測序是可行的。“我們的研究已經證明，我們能夠從血液中可靠地獲得癌癥外顯子組。它與腫瘤活檢相匹配，對相當一部分轉移性癌癥患者有用，”Adalsteinsson博士指出。  之后，研究人員對41名患者開展進一步分析，將腫瘤活檢結果與游離DNA的外顯子測序數據相比較。他們發現，外顯子組測序和組織活檢的遺傳數據在很大程度上匹配，比如體細胞突變的匹配度達88%，拷貝數改變的匹配度達80%。這些結果表明，游離DNA的全外顯子組測序有望替代許多患者的轉移性腫瘤活檢。  

總的來說，這項新的研究改進了血液活檢的分析流程，使其能夠在更大范圍內開展。研究人員正在積極地將這項成果應用在數千名轉移性癌癥患者上。“這項技術讓我們能夠追蹤癌癥的動態變化，了解耐藥性的演化以及轉移性狀態的發展，這是手術活檢無法實現的，”Broad研究所的Gad Getz談道。