2011年6月14日,由華大基因、基因組標準協會 (GSC)和地球環境微生物聯盟(EMP)共同舉辦的*屆地球環境微生物計劃(Earth Microbiome Project)會議在深圳大梅沙京基海灣酒店隆重召開。來自美國阿貢國家實驗室、荷蘭生態學研究所、美國南加利福尼亞大學、美國勞倫斯伯克利國家實驗室、澳大利亞新南威爾士大學、新西蘭懷卡托大學、德國圖賓根大學、法國里昂*理工學院、香港大學、中科院南京土壤研究所、中科院東北地理與農業生態研究所等科研機構的100多位專家學者參加了此次會議。
上午八點半,會議在華大基因宏基因組業務總監胡濱的主持下正式開始,華大基因理事長楊煥明院士致歡迎詞。來自美國芝加哥大學阿貢國家實驗室的Rick Stevens教授向大家詳細介紹了地球環境微生物計劃(EMP)的項目內容和整體實施計劃,并指出,“合作的日益密切以及測序技術、數據處理及計算能力的快速發展,使得我們有機會可以開拓用這種分散的、有挑戰性的研究方法來進行的大量樣品的收集、處理、測序及分析等工作。”隨后,來自各地的專家學者相互分享了微生物學在生態、健康、醫學、工業、農業等各領域中的學術成果以及微生物基因組學的應用。大會報告如“大規模和小規模研究相結合揭示土壤微生物多樣性”,“*屆地球環境微生物計劃:10,000個樣本的初步研究”,“大豆結瘤的土壤宏基因組學研究”,“基于主要衣殼蛋白基因g23分析基礎上的T4噬菌體的性分布”,“水生生物的環境微生物計劃的研究——具有zui多微生物的生態系統”等引起了與會者的關注。華大基因執行總裁王俊結合華大參與的德國致病性大腸桿菌項目和人類腸道宏基因組項目(MetaHIT)向大家介紹了人腸道微生物和環境宏基因組學之間的。
EMP計劃旨在分析范圍內微生物群落的多樣性及功能,該項目將對典型的環境樣本進行宏基因組測序包括土壤、海洋、空氣、淡水生態系統等整個地球表面的絕大多數的微生物群落。華大基因擁有*的科研平臺和測序分析能力,將負責EMP亞洲地區環境樣本的收集,并對整個項目提供宏基因組測序以及相關的生物信息學分析。此外,隨著測序技術的不斷發展,各類基因組研究項目所產生的海量數據的存儲及處理問題將面臨更加嚴峻的考驗,EMP項目也將如此。針對此問題,在大會第二天,《(Giga)n Science》的執行編輯Scott C. Edmunds將會為各位參會者具體介紹《(Giga)n Science》雜志在進行數據管理和使用方面的情況。該刊由華大基因主辦,主要采用全文文獻與大型數據庫相結合的嶄新模式,促進數據的透明性和再現性,挖掘數據可利用的zui大潛力,從而為廣大科學工作者提供前沿、有效的數據以及生物學發現等資源。
此次研討會學術氣氛濃厚,學者反響熱烈,為微生物研究領域的專家學者們提供了一個良好的交流平臺,華大基因作為zui大規模的基因組學研究中心和本次會議的主辦方,擁有大規模的基因組測序平臺和強大的生物信息學分析能力,通過資源整合、創新的合作機制,將提高我國在環境微生物研究應用領域的自主創新能力和競爭水平。
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