水體磷的污染主要來源于下述幾個途徑:人體(糞便)排磷、含磷洗衣粉排磷、畜禽排磷、農業(化肥流失)、工業(污染)排磷、及水產養殖排磷等。
生物法除磷是利用微生物在好氧條件下對污水中溶解性磷酸鹽的過量吸收作用然后沉淀分離而除磷。含有過量磷的污泥部分以剩余污泥的形式排出系統,大部分和污水一起進入厭氧狀態,此時污水中的有機物在厭氧發酵的作用下轉化為乙酸苷;而活性污泥中硝磷墮在厭氧的不利狀態下,將體內機具的聚磷分解,分解產生的能量部分共聚磷菌生存,另一部分能量供聚磷菌主動吸收乙酸苷轉化為PHB的形態儲藏與體內。聚磷分解形成的無機磷釋放回污水中,這就是厭氧放磷。進入好氧狀態后,聚磷菌將儲存于體內的PHB進行好氧分解并釋放大量能量供聚磷菌增值,部分供其主動吸收污水中磷酸鹽,以聚磷的形式積聚于體內,這就是好氧吸磷。由于活性污泥在運行中不斷增值,俄日了系統的穩定運行,必須從系統中排除和增殖量相當的活性污泥,也就是剩余污泥。剩余污泥中包含過量吸收磷的聚磷菌,也就是從污水中去除的含磷物質。這就是厭氧和好氧交替的生物處理系統除磷的本質。