固相萃取填料從預處理到樣品加入時都保持濕潤，允許大約1毫升的預處理溶劑在管過濾片(frit)或萃取片表面之上。如果樣品是從一個貯液管或過濾管引入固相萃取管，則多加入0。5毫升zui后的預處理溶劑到1毫升的固相萃取管中，如果是2毫升到3毫升的萃取柱中，多加入4升到6毫升管中等等。這是為了保證在樣品加入之前萃取柱濕潤。如果在樣品加入之前，萃取柱中的填料干了，重復預處理過程。在重新引入有機溶劑之前，用水沖洗柱中緩沖溶液的鹽。甲醇濕潤吸附劑表面和滲透鍵合烷基相，固相萃取柱以允許水更有效地濕潤硅膠表面。有時前預處理溶劑使用在甲醇之前。這些溶劑通常是與洗脫溶劑一樣，是用之消除固相萃取管上的雜質及其對分析物的干擾，也可能該雜質只溶于強洗脫溶劑。
 
固相萃取應用于處理液體樣品，用來萃取、濃縮和凈化樣品中的揮發性和半揮發性化合物;當需要用于固體樣品時，須先把固體樣品處理為液態。固 相萃取SPE的應用十分廣泛,如生物液體包括血液、尿液、血清和血漿及細胞質的分析;牛奶處理、酒類、飲料及果汁分析;水資源的分析與監控;果蔬谷物及各 種植物組織和動物組織;藥片等固體藥物;水中多環芳烴、多氯聯苯等有機物分析，果蔬、食品中農藥和除草劑殘留分析，抗生素和臨床藥物分析。當樣品溶液通過吸附劑床時，分離物在吸附劑上不移動。固相萃取柱保留是三個因素的作用：分離物、溶 劑和吸附劑。所以，一個給定的分離物的保留行為在不同溶劑和吸附劑存在下是變化的。