通常二次供水紫外線消毒器可用于綠氣和次氯酸鹽供應困難的地區和水處理后對氯的消毒副產物有嚴格限制的場合。一般認為當水溫較低時用紫外線消毒比較經濟。

二次供水紫外線消毒器

不在水中引進雜質，水的物化性質基本不變；

水的化學組成（如氯含量）和溫度變化一般不會影響消毒效果；

不另增加水中的嗅、味，不產生諸如三鹵甲烷等類的消毒副產物；

殺菌范圍廣而迅速，處理時間短，在一定的輻射強度下一般病原微生物僅需十幾秒即可殺滅，能殺滅一些氯消毒法無法滅活的病菌，還能在一定程度上控制一些較高等的水生生物如藻類和紅蟲等；

過度處理一般不會產生水質問題；

一體化的設備構造簡單，容易安裝，小巧輕便，水頭損失很小，占地少；

容易操作和管理，容易實現自動化，設計良好的系統的設備運行維護工作量很少；

運行管理比較安全，基本沒有使用、運輸和儲存其他化學品可能帶來的劇毒、易燃、爆炸和腐蝕性的安全隱患；

消毒系統除了必須運行的水泵以外，沒有其他噪音源。殺菌效果是由微生物所接受的照射劑量決定的，同時，也受到紫外線的輸出能量，與燈的類型，光強和使用時間有關，隨著燈的老化，它將喪失30%-50%的強度。紫外照射劑量是指達到一定的細菌滅活率時，需要特定波長紫外線的量：照射劑量（J/m2）=照射時間（s）×UVC強度（W/m2）照射劑量越大，消毒效率越高，由于設備尺寸要求，一般照射時間只有幾秒，因此，燈管的UVC輸出強度就成了衡量紫外光onclick="g('消毒設備');">消毒設備性能主要的參數。在城市污水消毒中，一般平均照射劑量在300 J/m2以上。低于此值，有可能出現光復活現象，即病菌不能被*殺死，當從渠道中流出接受可見光照射后，重新復活，降低了殺菌效果。殺菌效率要求越高，所需的照射劑量越大。影響微生物接受到足夠紫外光照射劑量的主要因素是透光率（254 nm處），當UVC輸出強度和照射時間一定時，透光率的變化將造成微生物實際接受劑量的變化。