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貨號 | XG-P2723 | 規格 | 1ml |
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包裝 | 盒裝 | 用途 | 僅供科研研究實驗 |
RNAlong RNA 長期保存液
貨號 | 規格 | 分類 |
XG-P2723 | 1ml | 核酸純化 |
保存條件:4℃。
產品介紹:
RNA性質不穩定,極易降解。溶解于無RNase的TE 或水中的純化RNA,即便是儲存于-20 oC也難免降解。為解決這一問題,可以將RNA沉淀或RNA溶液溶解于RNA 長期保存液中,允許RNA 4oC保存或-20oC至少保存1年而免于降解。RNA長期保存液是RNA樣品運輸和中長期保存的佳選擇。需要時可用常規乙醇法沉淀回收RNA,或直接吸取儲存于RNA 溶解保護液中的高濃度RNA(可達4 mg/ml)進行RNA 電泳、Northern Blot。
注意事項:
1. RNA 長期保存液可能抑制逆轉錄酶活性,做 RT-PCR 反應前應該用乙醇沉淀 RNA。
2. 在 RNA 長期保存液中的 RNA 的終濃度不應該超過 4μg /μl。用 RNA 長期保存液溶解 RNA 沉淀:
1. 對固體 RNA 沉淀,每 0.4-4μg RNA 沉淀加入 1μl RNA 長期保存液,反復吹打混勻或者室溫振蕩 15-30 min 溶解沉淀。干燥的 RNA 沉淀難以溶解,可反復吹打混勻后 50oC 加熱 10-15 min。先用小體積無 RNase 的TE 或水溶解 RNA 沉淀,然后按液態 RNA 操作。
2. 對液態 RNA 溶液,每 0.4-4μg RNA 溶液加入 1μl RNA 長期保存液,混勻。注意混合液中 RNA 長期保存液的體積百分比不低于 80%。
3. 測定 OD 值。注意加入相應量的 RNA 長期保存液做空白。
4. 將溶解的 RNA 樣品儲存于-20 oC 或者-70 oC。從 RNA 長期保存液中沉淀 RNA:
1. 估計 RNA 溶液終體積。加入 4 倍體積的無水乙醇,混勻。如果溶液體積過小,可加入 RNase free water 稀釋 RNA 溶液,如果溶液中 RNA 含量低于 0.25μg /μl,可加入 5M NaCl(RNase free) 至終濃度 0.2M,混勻后再加入 4 倍體積乙醇。
2. 室溫放置 5 min。
3. 12,000rpm 離心 5 min,棄上清,風干,溶解。
4. 重新沉淀的 RNA 溶解后可用于 RT-PCR 反應。也可用于任何其他實驗。直接使用 RNA 長期保存液中的 RNA:直接吸取 RNA 長期保存液中的 RNA,進行普通或甲醛變性電泳和 Northern Blot。進行甲醛變性電泳時,最后上樣的樣品中的 RNA 長期保存液的濃度可高達 50%。
附:甲醛變性電泳樣品準備: 臨用前,混合水(87μl),甲醛(81μl),50%甘油/含 0.25 mg/ml 溴芬蘭(48μl ) 和20X MOPS (24μl). 將上述混合液和 RNA 長期保存液中的 RNA 樣品等體積混合,55 oC 溫育 10 min,按照標準的甲醛變性電泳過程上樣。
一、模板DNA:PCR反應需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;
二、引物:PCR反應的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;
三、dNTPs:PCR反應中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成 等生物學過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;
四、Taq DNA聚合酶:PCR反應需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;
五、PCR buffer溶液:對PCR反應具有緩沖作用,調節反應pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應特異性,從而提高反應效率;
六、酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。
七、MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。
八、DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應產物;
①Oligo dT
選擇Oligo dT時,要求RNA必須有Poly A,所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT,對RNA樣品的質量要求較高,不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應,建議推薦使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比隨機引物和特異性引物的穩定性要好。
②隨機引物
適合各種RNA的RT,尤其適合模板豐度很低的情況(比如某個gene表達量很低)。選擇隨機引物時,鏈cDNA合成反應中就是以所有的RNA為模板,然后進行PCR反應時設計引物進行特異性擴增。同時要注意隨機引物的量和總RNA量之間的關系,一般建議每5µg總RNA的隨機引物的用量為50ng,如果每5µg總RNA的隨機引物的用量超過250ng,可能會導致小片段產物(<500bp)的增加和長片段、全長產物的降低。
③特異性引物
基因特異性引物(GSP)是某個基因序列的一部分,與模板互補的引物。該引物需要結合目標RNA的已知序列進行設計。由于引物和RNA序列特異性結合,每個目標RNA都需要一套新的基因特異性引物。因此,當分析多種目標時,則需要適用更多的RNA樣本。而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以一般不推薦使用。如需要使用特異性引物,建議對退火溫度進行優化。
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